冷凍・冷蔵倉庫の設備投資補助金｜神奈川の物流網強化

公開日: 2026年10月04日

神奈川県の倉庫業・物流センターが冷凍・冷蔵倉庫の設備導入やコールドチェーン強化に使える補助金を解説。ものづくり補助金（補助率1/2〜2/3）、省力化投資補助金（上限最大1億円）、業務改善助成金（上限600万円）など。

神奈川県で倉庫業・物流センターを営む中小事業者が冷凍倉庫・冷蔵倉庫の設備投資やコールドチェーン強化を進める場合、ものづくり・商業・サービス生産性向上促進補助金（補助率1/2もしくは2/3）、中小企業省力化投資補助金（補助率1/2〜2/3・上限は従業員規模により200万円〜最大1億円）、神奈川労働局が受け付ける業務改善助成金（補助率3/4〜4/5・上限600万円）が使える可能性があります。配送車両のEV化には、令和8年度神奈川県事業用等EV導入費補助金も候補になります。

冷凍・冷蔵倉庫の設備投資は、物流事業者にとって大きな負担

食品や医薬品を扱う物流センターでは、温度管理の精度がそのまま取引先からの信頼につながります。一方で、冷凍機や冷蔵設備の更新、保冷エリアの増設、入出庫を自動化するマテハン機器の導入は、一度に数百万円から数千万円の投資が必要です。

さらに、神奈川県では最低賃金の引き上げと人手不足が重なり、「設備を入れて省人化したいが資金が足りない」「電気代の高い旧式の冷凍設備を更新したいが踏み切れない」という声が多く聞かれます。こうした設備投資の負担を軽くする手段として、国や県の補助金・助成金が用意されています。

冷凍・冷蔵倉庫設備やコールドチェーン強化に使える可能性のある補助金

ものづくり・商業・サービス生産性向上促進補助金（23次締切）

中小企業が生産プロセスの改善や革新的なサービス開発のために行う設備投資を支援する国の制度です。冷凍・冷蔵倉庫の温度管理システム、省エネ型冷凍機、入出庫の自動化設備など、物流サービスの生産性を高める投資が対象になり得ます。

• 対象地域: 全国（日本国内に本社と実施場所があること）
• 補助率: 1/2もしくは2/3
• 上限額: 申請枠・従業員規模で異なるため公募要領で確認が必要
• 注意点: 申請締切日前10か月以内に同一事業の交付決定を受けた事業者は対象外。設備導入が「生産性向上」にどうつながるかを事業計画で示す必要があります

中小企業省力化投資補助金（カタログ注文型・一般型）

人手不足に悩む中小企業が、IoT・ロボットなど省力化効果のある設備を導入する経費を補助する制度です。物流センターの自動搬送機、自動倉庫、検品の自動化など、省人化に直結する設備投資と相性がよい補助金です。

• カタログ注文型: 登録済みの汎用製品を選んで導入。補助率1/2以下、上限は従業員5名以下200万円・6〜20名500万円・21名以上1,000万円（賃上げ達成時はそれぞれ増額）。随時公募受付中
• 一般型: 現場に合わせた設備導入やシステム構築。補助率は中小企業1/2（大幅賃上げで2/3）・小規模事業者等2/3、上限750万円〜8,000万円（大幅賃上げ時は最大1億円）
• 注意点: 申請にはGビズIDプライムが必要。「人手不足の状態にあること」が前提条件です

業務改善助成金（神奈川労働局受付・令和8年度）

事業場内で最も低い賃金を50円以上引き上げ、あわせて生産性向上に資する設備投資を行った場合に、その費用の一部を助成する制度です。補助率が高いのが特徴で、賃上げを予定している倉庫事業者には有力な選択肢です。

• 補助率: 3/4〜4/5
• 上限額: 600万円
• 注意点: 申請期間は令和8年9月1日から、神奈川県の地域別最低賃金発効日の前日または11月30日のいずれか早い日まで。期間が限られるため早めの準備が必要です。申請先が神奈川労働局であることを確認し、添付書類の漏れに注意してください

令和8年度神奈川県事業用等EV導入費補助金

物流網強化の一環として配送車両の更新を考える場合、EVトラックの車両本体購入費を県が補助する制度があります。対象は県内でトラック事業などに供するEVの所有者となる法人・個人事業者、またはリース事業者です。倉庫業のみで自社トラックを運行していない場合は対象外となる可能性があるため、要件の確認が必要です。

申請までの一般的な流れ

• 公募要領の確認: 各制度の公式サイトで最新の公募要領を読み、対象経費に冷凍・冷蔵設備や自動化機器が含まれるか、自社が対象者要件を満たすかを確認します
• 事前準備: GビズIDプライムの取得（発行に時間がかかります）、設備メーカーからの見積取得、直近の決算書や賃金台帳の整理を進めます
• 事業計画の作成: 導入する設備で何がどれだけ改善するか（保管能力、入出庫時間、人員配置、電力コストなど）を数値で示します
• 申請・交付決定後に発注: 多くの制度は交付決定前の発注・契約が補助対象外です。発注の順番を間違えないよう注意してください

まとめ

神奈川県の倉庫業・物流センターが冷凍倉庫・冷蔵倉庫の設備投資やコールドチェーン強化を行う際は、ものづくり補助金、省力化投資補助金、業務改善助成金、県のEV導入費補助金など、複数の制度が候補になります。それぞれ対象要件や締切が異なり、公募状況も変わるため、必ず公式サイトで最新情報を確認してください。

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